Integrative spatial profiling of 3D genome organization and gene expression in tissue.
期刊Cell
发表日期2026-08-25
影响因子IF 45.1
涉及基因未提及
编辑类型未使用基因修饰模型
实验用途开发Spatial Hi-C-RNA技术，在近单细胞分辨率下同时绘制组织切片中的全基因组染色质互作和转录组
中文研究总结
本文开发了Spatial Hi-C-RNA多模态平台，能够在同一组织切片上同时绘制全基因组染色质接触图谱和转录组，实现近单细胞分辨率的空间组学分析。在小鼠大脑、发育胚胎和人类黑色素瘤中的验证表明，该技术生成的多模态图谱与组织解剖结构一致，并揭示了互补的染色质和RNA定义的空间模式。多尺度特征包括A/B区室、拓扑关联结构域和染色质环，与区域和细胞类型特异性的转录程序相关联。在小鼠胚胎中，该技术解析了神经元成熟过程中染色质和转录的协同重塑。人类黑色素瘤分析显示，染色质架构能识别RNA无法检测的肿瘤内亚区，并揭示肿瘤状态转换与区室化、域边界和调控程序的关联。该技术为在原生组织环境中研究基因组结构与功能关系提供了广泛适用的新框架，在发育和疾病研究中具有重要应用价值。
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