Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo.
期刊Nature genetics
发表日期2026-08-26
影响因子IF 25.5
涉及基因未提及
编辑类型未使用基因修饰模型
实验用途使用深度学习设计在小鼠胚胎中具有组织特异性的合成增强子
中文研究总结
本研究开发了一种在哺乳动物胚胎中设计功能性组织特异性增强子的通用策略。研究团队使用卷积神经网络，基于经过整理的染色质可及性数据进行训练，并通过对已验证的人和小鼠增强子进行迁移学习来微调模型。在此模型指导下，设计了15个针对心脏、肢体和中枢神经系统的合成增强子，并在小鼠胚胎中进行验证，结果显示所有增强子都在预期目标组织中表现出活性。该研究证明了仅从DNA序列即可可靠推断哺乳动物增强子功能，实现组织特异性合成增强子的可预测从头设计，为功能基因组学、合成生物学和基因治疗提供了可编程控制哺乳动物基因表达体内应用的通用框架。
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