Single-cell and in vivo profiling reveal heterogeneous and organ-specific CRISPR-Cas9 off-target and translocation outcomes.
期刊Nature communications
发表日期2026-08-26
影响因子IF 18.1
涉及基因未提及
编辑类型转基因
实验用途单细胞和体内分析CRISPR-Cas9脱靶及易位结果，评估基因编辑安全性
中文研究总结
本研究建立了在体外单细胞分辨率和体内不同组织中解析Cas9脱靶活性的工作流程。使用电转的小鼠胚胎和胚胎干细胞进行克隆扩增，揭示单个细胞表现出独特的脱靶和易位特征，包括批量分析中遗漏的事件。单细胞编辑与染色质可及性、转录和DNA甲基化测量的整合表明，序列非依赖性特征调节Cas9的进入和切割，偏好编辑开放染色质和低甲基化区域。在Cas9诱导型小鼠模型中，编辑分析显示不同器官具有独特的脱靶谱、DNA修复途径使用、indel模式以及组织间显著不同的易位倾向。这些发现表明脱靶活动在细胞间是异质的，在器官间是依赖情境的，为临床前开发中更准确评估风险和改进CRISPR基因药物的安全性，需要灵敏的单细胞分析和器官特异性评估提供了依据。
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