In vivo CRISPRi screens reveal Escherichia coli functional adaptations in the mouse gut.
期刊Nature microbiology
发表日期2026-09-17
影响因子IF 19.4
涉及基因未提及
编辑类型未使用基因修饰模型
实验用途利用CRISPRi体内筛选技术揭示大肠杆菌在小鼠肠道中的功能适应机制。
中文研究总结
本研究建立了一个基于CRISPR干扰的体内筛选平台，以细菌基因适应度作为高分辨率功能报告因子，探究大肠杆菌在小鼠肠道中的适应机制。研究使用携带明确最小微生物群落(OligoMM12)的小鼠模型，发现饮食显著塑造大肠杆菌的代谢景观和必需基因图谱，并识别出交叉喂养互作关系。通过比较实验室菌株(MG1655)、尿路致病菌(CFT073)和粘附侵袭性大肠杆菌(AIEC LF82)，揭示了肠道定植的遗传需求差异，包括运动性、应激反应和呼吸策略的不同。在宿主炎症环境中，AIEC LF82更倾向于定植小肠，且Gally前噬菌体这一移动遗传元件在调节适应度中发挥重要作用。该研究提供了大肠杆菌功能适应的高分辨率遗传图谱，并展示了功能基因组学在探究肠道环境本身方面的应用价值。
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