Resolving cell-cell interaction networks and their molecular logic in complex tissues.
期刊Nature methods
发表日期2026-10-05
影响因子IF 28.3
涉及基因Apc
编辑类型敲除(knockout)
实验用途开发CCI-seq方法用于高通量捕获组织中的细胞间相互作用网络
中文研究总结
本研究开发了CCI-seq方法，结合细胞团块组合索引与单细胞测序，实现了对邻近连续体中细胞-细胞相互作用的无偏倚捕获。该方法在 mouse kidney 和 intestine 中验证了已知相互作用并发现精细的细胞组织结构。构建 Apc 敲除(Apc-KO)肠道模型，揭示了腺瘤性息肉病基因敲除后的异常细胞相互作用和破坏的空间组织。应用至人类结直肠癌，发现与临床分类相关的亚型特异性相互作用。功能分析表明相互作用细胞关联不同的转录程序：肾脏中驱动离子转运、Apc-KO 肠绒毛中驱动抗原呈递、结直肠癌中驱动NF-κB炎症激活。CCI-seq 提供了可扩展的平台来揭示大规模细胞相互作用网络并解析其分子和功能影响，增进对复杂多细胞系统的理解。
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